Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ROPN1LQ96C74 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ROPN1LQ96C74 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROPN1LQ96C74 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms