Protein–RNA interactions for Protein: Q96C00

ZBTB9, Zinc finger and BTB domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB9Q96C00 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBTB9Q96C00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBTB9Q96C00 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBTB9Q96C00 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBTB9Q96C00 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBTB9Q96C00 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms