Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM63Q969Q1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM63Q969Q1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM63Q969Q1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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