Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMTQ93088 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BHMTQ93088 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BHMTQ93088 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BHMTQ93088 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMTQ93088 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms