Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNFRSF25Q93038 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF25Q93038 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFRSF25Q93038 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNFRSF25Q93038 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFRSF25Q93038 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms