Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT35Q92764 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT35Q92764 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT35Q92764 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms