Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX38Q92620 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DHX38Q92620 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DHX38Q92620 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX38Q92620 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms