Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSC1Q92574 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSC1Q92574 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TSC1Q92574 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSC1Q92574 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TSC1Q92574 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSC1Q92574 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSC1Q92574 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSC1Q92574 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSC1Q92574 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TSC1Q92574 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSC1Q92574 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSC1Q92574 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSC1Q92574 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSC1Q92574 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSC1Q92574 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSC1Q92574 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TSC1Q92574 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSC1Q92574 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSC1Q92574 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSC1Q92574 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSC1Q92574 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSC1Q92574 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSC1Q92574 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSC1Q92574 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSC1Q92574 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSC1Q92574 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TSC1Q92574 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSC1Q92574 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TSC1Q92574 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSC1Q92574 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms