Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S1Q92572 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S1Q92572 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms