Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM9SF4Q92544 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TM9SF4Q92544 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms