Protein–RNA interactions for Protein: Q92538

GBF1, Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBF1Q92538 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GBF1Q92538 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GBF1Q92538 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GBF1Q92538 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GBF1Q92538 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBF1Q92538 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GBF1Q92538 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBF1Q92538 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GBF1Q92538 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBF1Q92538 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBF1Q92538 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBF1Q92538 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBF1Q92538 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GBF1Q92538 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBF1Q92538 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBF1Q92538 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBF1Q92538 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GBF1Q92538 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GBF1Q92538 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBF1Q92538 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBF1Q92538 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBF1Q92538 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBF1Q92538 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GBF1Q92538 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBF1Q92538 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GBF1Q92538 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBF1Q92538 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GBF1Q92538 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBF1Q92538 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBF1Q92538 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GBF1Q92538 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBF1Q92538 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms