Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1l1Q923U0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tom1l1Q923U0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tom1l1Q923U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tom1l1Q923U0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1l1Q923U0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1l1Q923U0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1l1Q923U0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms