Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubb6Q922F4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tubb6Q922F4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubb6Q922F4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubb6Q922F4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubb6Q922F4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 390.7 ms