Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TardbpQ921F2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TardbpQ921F2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TardbpQ921F2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TardbpQ921F2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms