Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc1Q91Z38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc1Q91Z38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc1Q91Z38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc1Q91Z38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc1Q91Z38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms