Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp1bQ91YK2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp1bQ91YK2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1bQ91YK2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1bQ91YK2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms