Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Synpo2Q91YE8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Synpo2Q91YE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Synpo2Q91YE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Synpo2Q91YE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Synpo2Q91YE8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms