Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec16bQ91XT4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec16bQ91XT4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec16bQ91XT4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec16bQ91XT4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms