Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps11Q91W86 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps11Q91W86 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps11Q91W86 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps11Q91W86 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms