Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pth2Q91W27 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pth2Q91W27 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pth2Q91W27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms