Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ5

Pqbp1, Polyglutamine-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqbp1Q91VJ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pqbp1Q91VJ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pqbp1Q91VJ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pqbp1Q91VJ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Pqbp1Q91VJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pqbp1Q91VJ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pqbp1Q91VJ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pqbp1Q91VJ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pqbp1Q91VJ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pqbp1Q91VJ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pqbp1Q91VJ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pqbp1Q91VJ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms