Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PYDC1Q8WXC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PYDC1Q8WXC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms