Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF31Q8WWY3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF31Q8WWY3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF31Q8WWY3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF31Q8WWY3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms