Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRUB1Q8WWH5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB1Q8WWH5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB1Q8WWH5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms