Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APH1BQ8WW43 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APH1BQ8WW43 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APH1BQ8WW43 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms