Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJA4Q8WW22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA4Q8WW22 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms