Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SfpqQ8VIJ6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SfpqQ8VIJ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SfpqQ8VIJ6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SfpqQ8VIJ6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms