Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dkk4Q8VEJ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dkk4Q8VEJ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dkk4Q8VEJ3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dkk4Q8VEJ3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dkk4Q8VEJ3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms