Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms