Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smg8Q8VE18 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg8Q8VE18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg8Q8VE18 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smg8Q8VE18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg8Q8VE18 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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