Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCY6

Utp6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp6Q8VCY6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp6Q8VCY6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp6Q8VCY6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Utp6Q8VCY6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Utp6Q8VCY6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Utp6Q8VCY6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms