Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC48

Pex12, Peroxisome assembly protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex12Q8VC48 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex12Q8VC48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pex12Q8VC48 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex12Q8VC48 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex12Q8VC48 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex12Q8VC48 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms