Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ApobrQ8VBT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ApobrQ8VBT6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ApobrQ8VBT6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ApobrQ8VBT6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ApobrQ8VBT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ApobrQ8VBT6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ApobrQ8VBT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ApobrQ8VBT6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ApobrQ8VBT6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms