Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD5Q8TDI0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD5Q8TDI0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD5Q8TDI0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD5Q8TDI0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD5Q8TDI0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHD5Q8TDI0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms