Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cd109Q8R422 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cd109Q8R422 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cd109Q8R422 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cd109Q8R422 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cd109Q8R422 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cd109Q8R422 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cd109Q8R422 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cd109Q8R422 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cd109Q8R422 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Cd109Q8R422 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms