Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc12Q8R344 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc12Q8R344 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc12Q8R344 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms