Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2U2

Nepro, Nucleolus and neural progenitor protein, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeproQ8R2U2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NeproQ8R2U2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeproQ8R2U2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeproQ8R2U2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeproQ8R2U2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeproQ8R2U2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeproQ8R2U2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeproQ8R2U2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeproQ8R2U2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms