Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RorbQ8R1B8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RorbQ8R1B8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RorbQ8R1B8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RorbQ8R1B8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms