Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEST4Q8NFU0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEST4Q8NFU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEST4Q8NFU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEST4Q8NFU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEST4Q8NFU0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEST4Q8NFU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BEST4Q8NFU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BEST4Q8NFU0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BEST4Q8NFU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BEST4Q8NFU0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BEST4Q8NFU0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms