Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER1Q8NEC5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CATSPER1Q8NEC5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms