Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMG8Q8ND04 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMG8Q8ND04 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMG8Q8ND04 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMG8Q8ND04 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMG8Q8ND04 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms