Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HJURPQ8NCD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HJURPQ8NCD3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HJURPQ8NCD3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms