Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA6

C15orf53, Uncharacterized protein C15orf53, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf53Q8NAA6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C15orf53Q8NAA6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C15orf53Q8NAA6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
C15orf53Q8NAA6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf53Q8NAA6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C15orf53Q8NAA6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms