Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BMPERQ8N8U9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BMPERQ8N8U9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BMPERQ8N8U9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMPERQ8N8U9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms