Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms