Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ANKRD35Q8N283 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ANKRD35Q8N283 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ANKRD35Q8N283 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ANKRD35Q8N283 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ANKRD35Q8N283 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ANKRD35Q8N283 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ANKRD35Q8N283 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ANKRD35Q8N283 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms