Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q0

Rptor, Regulatory-associated protein of mTOR, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptorQ8K4Q0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RptorQ8K4Q0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RptorQ8K4Q0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RptorQ8K4Q0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RptorQ8K4Q0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RptorQ8K4Q0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RptorQ8K4Q0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RptorQ8K4Q0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
RptorQ8K4Q0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RptorQ8K4Q0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RptorQ8K4Q0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RptorQ8K4Q0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RptorQ8K4Q0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RptorQ8K4Q0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RptorQ8K4Q0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RptorQ8K4Q0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 765.4 ms