Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4K6

Pank1, Pantothenate kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank1Q8K4K6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pank1Q8K4K6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pank1Q8K4K6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pank1Q8K4K6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pank1Q8K4K6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pank1Q8K4K6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pank1Q8K4K6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Pank1Q8K4K6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pank1Q8K4K6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pank1Q8K4K6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pank1Q8K4K6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms