Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1eQ8K202 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1eQ8K202 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1eQ8K202 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1eQ8K202 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1eQ8K202 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms