Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc4a8Q8JZR6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc4a8Q8JZR6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc4a8Q8JZR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc4a8Q8JZR6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms