Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPAS3Q8IXF0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPAS3Q8IXF0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms